Cục 749 kể về Ma Shan là một chàng trai trẻ sống trong thành phố Red Mine, nơi bất ngờ bị bao phủ bởi lớp sương mù dày đặc phát ra từ một mỏ bỏ hoang. Khi sinh vật bí ẩn mang tên Zero xuất hiện và đe dọa sự sống của toàn bộ cư dân, Ma Shan bị cuốn vào một tổ chức tuyệt mật có tên là Cục 749. Tại đây, anh buộc phải đối mặt với những thử thách vượt quá sức tưởng tượng, đồng thời khám phá những bí mật liên quan đến bản thân và số phận nhân loại. Hành trình trưởng thành của Ma Shan bắt đầu giữa ranh giới mong manh giữa hy vọng và diệt vong.
